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発売日

2011/06

商品説明

収録内容

1 分子動力学法の原理と生体高分子用分子動力学シミュレーションパッケージAmberの概説(分子動力学法とは?
分子動力学シミュレーションはどのような原理に基づいているか-ニュートンの運動方程式
原子どうしに働く力はどう決まっているか-力場ほか)
2 Amberで生体高分子のシミュレーションを行う-Amberチュートリアル(まずはAmberを使ってみる-インスタントプロトコル
核酸のモデリングとシミュレーション-nucgenとxleapを使って
Amberで用意されていない分子の残基表現ファイルを作成する-antechamberの使い方ほか)
3 Frequently Asked Questions(FAQ)(力場パラメーターの設定に関して
PDBファイルの読み込みに関わるトラブルについて
トラジェクトリーファイルの解析についてほか)